Snel herkennen van plantpathogenen

Via het PPS project ‘On-site plantpathogeen detectie voor plantgezondheid en fytosanitaire controle’ werken onderzoekers en bedrijven aan het ontwikkelen van nieuwe detectiemethoden voor onder andere bacteriën, schimmels en virussen (plantpathogenen). De uitdaging was niet alleen het testen op locatie (on-site) voor deze organismen, maar ook het testen op meerdere organismen in één reactie en de bruikbaarheid van een snel sequencing systeem te onderzoeken.

In het deelproject ‘On-site en Barcoding’, dat onlangs is afgerond, zijn daarvoor:

• snelle DNA/RNA extractie protocollen uit bladeren van verschillende gewassen opgesteld en uitgetest;
• voor diverse plantenpathogeen on-site LAMP testen ontwikkeld en uitgetest op besmette planten;
• methoden ontwikkeld en uitgetest om 6 verschillende tobamovirussen m.b.v. het snelle MinION sequencing systeem te detecteren in bladeren.

Kijk voor meer informatie op www.wur.nl of neem contact op met projectleider Peter Bonants via peter.bonants@wur.nl